关于中华和西方文明的一些矛盾，学者（包括亨廷顿本身）已多有论述，可以大致概括如下。继承了儒家精神的中华文明的核心价值包括：强调权威、重视等级、国家高于社会、社会高于个人、集体利益高于个人权利、保持一致的重要性、避免正面冲突、顾全面子、顾全大局。
这些价值观与西方文明拥抱的主要信念形成了强烈对照：自由、平等、民主、个人主义、不信任政府、反对权威、强调制衡、鼓励竞争、崇尚人权。此外，相对于中国人对历史的深刻铭记、将长远利益放在首位，美国人似乎倾向于忘记过去、忽视未来、集中精力尽可能扩大眼前的利益。这些价值矛盾是导致两大文明冲突的主要根源。
亨廷顿指出，美国是个具有浓厚传教士精神的国家，习惯按照自己的信条来看待其他国家，与美国信条相悖的就趋于对立——这意味着中美冲突无可避免。值得注意的是，亨廷顿认为所谓的普世价值并不存在。他认为，世界上每一种伟大的文明都是围绕着一套共同的价值观建立起来的，这些价值观植根于复杂的历史过往之中，而且这些价值观最终并不总是相互契合的。特别是，亨廷顿认为自由民主背后并没有所谓的普世价值。自由民主源于西方的经验，而且深深植根于欧洲的基督教历史。